Le strutture tecniche sono suddivise in 3 Aree di competenza:
- Area diagnostica
- Area di controllo degli alimenti e delle trasformazioni
- Area delle attività di servizio

Nell'Area diagnostica sono individuati 5 Reparti:
- R. batteriologia
- R. virologia
- R. agenti ad alta diffusione e biotecnologie diagnostiche
- R. genomica
- R. proteomica

Nell'Area di controllo degli alimenti e delle trasformazioni sono individuati 6 Reparti:
- R. chimica degli alimenti di origine animale
- R. chimica degli alimenti di origine vegetale e mangimi
- R. microbiologia
- R. chimica applicata alle tecnologie alimentari
- R. tecnologia acidi nucleici applicata agli alimenti
- R. produzioni primarie

Nell'Area delle attività di servizio sono individuati 4 Reparti:
- R. animali da laboratorio
- R. produzione terreni
- R. produzione vaccini e reagenti
- R. substrati cellulari e immunologia cellulare