L‘attività del Centro di Referenza dei Substrati Cellulari viene perseguita in accordo alle linee operative indicate dal Ministero della Salute. In particolare, il Centro è tenuto a:
 

- fornire agli altri laboratori degli Istituti Zooprofilattici Sperimentali e ad altri laboratori di ricerca, linee cellulari stabilizzate di origine animale ed umana e linee cellulari primarie allestite dalle più comuni specie animali;
- costituire supporto per gli altri laboratori per l‘attività di ricerca, anche ai fini dell‘adattamento di alcuni ceppi virali alle colture di tessuto;
- mettere a punto le procedure per la tipizzazione di nuovi substrati cellulari;
- determinare l‘impiego ottimale di talune particolari linee cellulari;
- effettuare corsi di aggiornamento per il personale tecnico alle nuove metodiche diagnostiche;
- informare gli altri istituti Zooprofilattici e l‘Istituto Superiore di Sanità nonché il Ministero sull‘impiego delle nuove metodiche diagnostiche mediante linee cellulari;
- disporre di una collezione di substrati cellulari, tipizzati, pronti per l‘impiego;