Attualmente il SEER fornisce i seguenti servizi:


- gestione dell‘Anagrafe zootecnica regionale;
- gestione del sistema informativo regionale sulle malattie infettive del bestiame soggette a denuncia obbligatoria (DPR 320/54);
- gestione del sistema informativo regionale sui piani di risanamento (Tubercolosi, Brucellosi e Leucosi Bovina Enzootica);
- gestione del sistema informativo regionale sui piani di sorveglianza delle malattie dei suini (Peste Suina Classica, Malattia Vescicolare del Suino da enterovirus, Malattia di Aujeszky);
- raccolta ed elaborazione dati di attività in materia di Sanità Pubblica Veterinaria;
- conduzione di indagini epidemiologiche (in collaborazione con i Servizi Veterinari USL competenti);
- diffusione delle informazioni connesse alle attività di sanità pubblica veterinaria attraverso la pubblicazione di relazioni e lettere informative;
- ricerca e sperimentazione;
- supporto tecnico-scientifico per la gestione gestione di alcuni sistemi informativi di IZSLER:Nome sistemaDescrizioneSEERSistema regionale per la raccolta dei dati di sorveglianza delle ASL dell‘Emilia-RomagnaCERVESSistema nazionale per la raccolta dei dati di sorveglianza della Malattia Vescicolare del suinoAujeszkySistema nazionale per la raccolta dei dati di sorveglianza della Malattia di AujeszkyThesaurusDizionario per lo scambio dati tra Regioni, IZS e ASL