Il Centro di Referenza Nazionale per il Benessere Animale collabora attivamente con:
- Università degli Studi di Milano - Dipartimento di Scienze Veterinarie e Sanità Pubblica - Istituto Zooprofilattico delle Venezie - CRPA, Centro Ricerche e Produzioni Animali S.p.A. - CRA Unità di Ricerca per la suinicoltura di Modena - Dipartimento di morfofisiologia veterinaria e produzioni animali dell‘Università di Bologna - Centro Interdisciplinare di Bioacustica e Ricerche Ambientali dell‘Università di Pavia - Associazione Regionale Allevatori della Lombardia