Attualmente il SEER fornisce i seguenti servizi:

• gestione dell'Anagrafe zootecnica regionale;
• gestione del sistema informativo regionale sulle malattie infettive del bestiame soggette a denuncia obbligatoria (DPR 320/54);
• gestione del sistema informativo regionale sui piani di risanamento (Tubercolosi, Brucellosi e Leucosi Bovina Enzootica);
• gestione del sistema informativo regionale sui piani di sorveglianza delle malattie dei suini (Peste Suina Classica, Malattia Vescicolare del Suino da enterovirus, Malattia di Aujeszky);
• raccolta ed elaborazione dati di attività in materia di Sanità Pubblica Veterinaria;
• conduzione di indagini epidemiologiche (in collaborazione con i Servizi Veterinari USL competenti);
• diffusione delle informazioni connesse alle attività di sanità pubblica veterinaria attraverso la pubblicazione di relazioni e lettere informative;
• ricerca e sperimentazione;
• supporto tecnico-scientifico per la gestione gestione di alcuni sistemi informativi di IZSLER: