Analisi del rischio ed epidemiologia genomica

Valutazione del rischio anche a supporto delle attivita nazionali ed internazionali di IZSLER. Modellizzazione matematica per la valutazione del rischio, di supporto alle decisioni e il controllo delle malattie infettive. Epidemiologia molecolare di patogeni a trasmissione alimentare e zoonosici per la sorveglianza integrata medico-veterinaria. Sequenziamento ed epidemiologia genomica, bioinformatica, gestione ed organizzazione dei dati di sequenziamento.

Valutazione del Rischio, Modelli Matematici ed Epidemiologia Genomica

Valutazione del rischio per le tematiche di competenza IZSLER. Analisi matematiche e statistiche finalizzate alla valutazione del rischio. Sviluppo di modelli epidemiologici di preparedness per malattie animali. Studio delle interazioni ospite-patogeno nelle infezioni batteriche a trasmissione alimentare. Studio genomico dell’antibiotico resistenza e dei flussi genici ad essa correlati in ambito umano e animale.

Centro di riferimento Enternet per patogeni enterici dell’Emilia-Romagna

Sorveglianza genomica one-health delle infezioni a trasmissione alimentare, in piena integrazione medico-veterinaria, che si basa sugli isolati umani di provenienza medica e sugli isolati di origine animale e alimentare ottenuti dall’attivita di sorveglianza istituzionale di IZSLER. Sviluppo di metodi bioinformatici e filogenomici per le indagini di focolaio e delle contaminazioni nelle produzioni alimentari.

Breve descrizione degli interessi di ricerca

Studio di presenza e prevalenza negli ambiti umano e veterinario dei geni mobili responsabili di resistenza ad antibiotici. Studio dei determinanti genetici che sottendono al fenotipo di Salmonelle con diversi livelli di patogenicita per l’uomo e i serbatoi animali, contribuendo alla comprensione dei meccanismi molecolari dell’adattamento batterico agli ospiti.
Sviluppo e gestione degli algoritmi di allerta epidemiologica one-health. Sviluppo di strumenti di condivisione e visualizzazione dei dati di sorveglianza e analisi genomica. Sviluppo di modelli per: (a) la valutazione delle performance di strategie di sorveglianza in sanita animale; (b) la graduazione del rischio nelle aziende zootecniche; (c) l’analisi della diffusione di antibiotico-resistenze tra i comparti umano e veterinario.